ไม้กวาดทางการแพทย์ที่ปลอดเชื้อไม่มีแบคทีเรียหรือจุลินทรีย์ที่มีชีวิตอื่นๆ วิธีการฆ่าเชื้อที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่ autoclave, ETO (Ethylene Oxide Gas) และรังสีแกมมา โดยทั่วไปแล้วจะใช้ไม้กวาดปลอดเชื้อสำหรับการเก็บตัวอย่างทางชีวภาพเพื่อหลีกเลี่ยงการปนเปื้อนตัวอย่าง และเพื่อวัตถุประสงค์ทางการแพทย์เพื่อหลีกเลี่ยงการติดเชื้อ